オートパイロットのコース選択

キャラ二人で艦隊を組んでボーナスを出しつつ輸送を行っていたら、
同じ目的地なのに、なぜか違うコースを飛んでいきましたよ・・・。
（Junp数は同じ、目的地設定の条件も同じ）

距離は計算していないようだし、目的地設定のコース選択って
どういう基準なんでしょうね？